Le village de Makrinitsa est au sein du massif du Pélion qui culmine à 1551 m et qui est recouvert de forêts, particulièrement fraiches en été. Il existe au sommet du massif une station de ski qui est ouverte en hiver.

Makrinitsa est situé à 500 m d'altitude face au golfe de Volos, la cité de Jason et des Argonautes.